腺伴隨病毒PCR試劑盒的PCR反應條件設置:
a)預變性:95℃,5 min可以讓白細胞裂解,釋放可用于PCR擴增的基因組DNA。請勿縮短時間或降低溫度。
b)退火溫度:退火溫度設置為引物Tm值即可。然而,使用高的退火溫度可以有效減少非特異性擴增,并提高全血模板的擴增效率。因此,如擴增產物特異性較差,可以建立一個溫度梯度反應去尋找引物模板zui適退火溫度。
c)延伸時間:按30 sec/kb設定,如不足30 sec,設置30 sec即可。
d)擴增循環數:35個循環已可以擴增足量產物。太多的循環將會導致非特異性擴增增加。
PCR完成后,建議將反應液于000× g (大約4000 rpm) 離心~3 min以沉淀血細胞碎片,之后取上清進行下游分析。該步驟可有效去除多種血液組分。當使用高濃度血液模板時此步尤為重要,因為經過PCR循環,反應管中會存在大量的血細胞碎片。這些碎片會干擾下游的檢測,如瓊脂糖電泳檢測。注意:由于血液本身的原因,PCR 結束后在 PCR 管的底部會出現透明凝膠狀物質,此為正常現象。